Hola de nuevo Playerbox,
Bueno, estos dias he estado haciendo pruebas con el Vsync/sb (supongo que será el equivalente al vsync/ac97) y si da problemas de sonido, pero tras hacer unas pruebas he conseguido solucionarlos .

Si pulsas F11 mientras juegas al advmame aparece arriba a la derecha 'Auto 100%-100%' y si te fijas verás que el sonido se oye mal cuando el segundo de los valores fluctua (aunque sea un 1%) causando problemas de sonido (crujidos, altibajos, repeticiones, etc...).
Tras fijarme y pensar un rato encontré la causa por la cual el advmame tiene esas pequeñas diferencias de velocidad...para mantener la sincronía de video (el Vsync), por lo tanto si desactivas el Vsync de las opciones de video del advmame verás como desaparecen todas las interfrencias del sonido ya que los juegos van constantemente al 100%. El único inconveniente de esto es que ocsionalmente se dará el 'efecto tearing' en la pantalla (aqui en la PRF EM022 viene explicado el efecto 'tearing' http://www.marcianitos.org/prf/emmame.htm#EM022 )

A mi me funcionó asi, a ver si a ti también.
Saludos.