otra opción es asignar al mando un puerto joystick del emulador, y depues seleccionarlo antes de empezar a jugar.

ej, establecer en el emulador, el pad1 a kemspton joystick. luego en el menu del juego debes seleccionar (usualmente es un número) este joystick y a jugar.
la mayoría de los juegos llevan como opción kemspton joystick ,por lo que es la opcion mas aconsejable.

el problema vendría, cuando cambian las teclas para seleccionarlo, en la la mayoría de los juegos será un número, pero en otros será una letra. lo cierto es que es complicado hacer un sistema que funcione para todos, puesto q estamos emulando un sistema q funcionaba con teclado.
quizá la mejor opción sea la que dice BUBU, aunque sea engorroso