en principio cambia la opción

show_dos_box yes por show_dos_box no

Te falta decirle al emulador el tipo de juego que
vas a utilizar, esto es:

default_options -gen -fullscreen

en el caso de mastersystem

default_options -sms -fullscreen

para game gear

default_options -gg -fullscreen

por lo demás la configuración es correcta

para los que utiliceis mamewah 1.6 la configuración sería

"[rompath]\[name].[romext]" -gen -fullscreen{nodosbox}{nosafelaunch}

"[rompath]\[name].[romext]" -gg -fullscreen{nodosbox}{nosafelaunch}

"[rompath]\[name].[romext]" -sms -fullscreen{nodosbox}{nosafelaunch}

Siento no poder contestar antes pero es que hay demasiado curro con el tema de reventones de tuberias por las heladas y solamente paso a echar un vistazo rápido. A ver si este fin de semana tengo un rato y le doy un repaso al frontend.