Ufff.Los SDD!!! Cuanto tiempo...y la tarjeta gáfica una Via s3 (s3 virge?¿?¿), un poco RETRO...no?¿?
Yo la uso Advmame y Advmenu, y lo que hago es configurarlo de esta manera.
Voy a pegar lo que puse en otro Post, que seguro que te ayuda:

CITAZIONE

Por partes...muchas preguntas de golpe. El advmame y el advmenu, se puden usar bajo winXP, con las resoluciones Standar de 640,800,1024 etc... No obstante, también se puede usar, conjuntamente con el TSR ADVV.EXE, para que acepte resoluciones nativas. El Advv.exe es un programa que permite a windows, usar otras modelines....o lo que es lo mismo, otras resoluciones y refrescos. No obstante, si quieres usar el Win Xp con tu Hantarex, necesitarás o bien la AVGA o bien el uso del PowerStrip...(este último es un auténtico coñazo). Si usas el ordenador de la máquina, tanto para viciar como para trabajar, entendería el uso del XP, pero si tienes la posibilidad de tener el ordenador de la máquina dedicado exclusivamente a ella, sigue con win98. Para configurar el Advmame y el Advmenu de Ms-Dos, sigue estos pasos:..(vamos a empezar desde cero....como si jamás lo hubieras configurado) 1º Te bajas el Advmame y Advmenu de DOS. 2º Los descomprimes en una carpeta...p.j.: C:/Advmame089...(primero el advmame y luego al advmenu...le das a todo que SI....te pedira si deseas reemplazar archivos existentes...tu que SI) 3º Te colocas sobre el Advmame.exe, click derecho, propiedades, y le especificas que se ejecute maximizado. En ese momento te aparecerá otro Advmame.exe pero con el icono de programa de Ms-Dos. 4º Te colocas sobre el Advmenu.exe, click derecho, propiedades, y le especificas que se ejecute maximizado. En ese momento te aparecerá otro Advmenu.exe pero con el icono de programa de Ms-Dos. 5º Ejecutas el Advmame.exe para crear el Advmame.rc, cercierote de que no esta protegido contra escritura. 6º Ejecutas el Advmenu.exe para crear el Advmenu.rc, cercierote de que no esta protegido contra escritura. 7º Si ahora ejcutaras el advcfg.exe, te saldría un mensaje de que no tienes configurado el video. 8º Te vas a la carpeta CONTRIB, y en ella hay una subcarpeta llamada DOCS, la abres, y en ella encontrarás unos ficheros TXT, llamados STANDART.TXT, MEDIUM.TXT, EXTENDED.TXT,etc.... 9º Abres el Standart.txt con el bloc de notas...y te aparecen 3 parametros, el P_Clock, y dos más....(ahora no recuerdo...estoy en el curro y te lo digo de memoria....si hay algún fallo , mil disculpas.) Bueno, copias los parametros del Standart.txt, y los copias al comienzo del Advmame.rc y Advmenu.rc, guardas cambio y los cierras. 10º Ahora te pones sobre el Advcfg.exe, click derecho, propiedades y ejecutar como maximizado. 11º Ejecutas el Advcfg.exe del icono de MS-Dos. 12º Te salen un chorro de posibles configuraciones, tu elijes la que ponga Standar Arcade monitor 15 khz CGA, lo centras...(segun lo veas necesario)...guardas cambios y ya estará. 13º Ejecutas el Advmenu.exe del Icono de Ms-dos y a viciar. Esos son los pasos, luego está que configures cada cosa...en el Advmenu, debes configurar los directorios de Roms, etc....y en el Advmame también. Doy por supuesto que sólo tienes conectado el monitor arcade al PC a traves de la salida de VGA. Una vez este todo configurado...si ves que hay una especie de barridos en los juegos horizontales, se puede ajustar....no deja de ser un desfase de sincronias......se llama Tearing. El caso, que para solventar ese pequeño problema, en el Advmame.rc, la opcion display_generate yclock...la pones en clocky. Por lo demás ya está. Para cualquier duda aqui estamos.

Un saludo.