Bájate la versión preparada de Project64 de MameWah (ese sí que lo tengo perfectamente funcionando con MameWah). Respecto a los plugins, en el mismo emu te vienen. Si bien puedes bajar, en caso de tener una Voodo 3Dfx, los plugins gráficos "Glide64" (Encontrarás links directos en la misma pág de project64).

Saludos