Hola Raptor2000,
Yo tengo un AMD Athlon a 1333Mhz y el Mortal Kombat 1 me va fluido (a 100% 53/53fps, con efectos direct3D y todo).
El 2 y el 3 me van lentos igual que a ti (por lo tanto es del ordenador). Lo que puedes probar para mejorar un poco el rendimiento es poner el mame 'a pelo' sin tocar ninguna opción, de esa forma irá lo más rápido posible.

Saludos.