Me dices entonces que sin JPAC, al final del JAMMA, en el pin 18 de la cara de componentes salen +5v normalmente, y al tirar la palanca hacia arriba aparecen 0v. Vale, eso está OK. Así que microswitch y JAMMA descartados.
Ahora vamos al JPAC. Pincha el JPAC teniendo en cuenta que viene un 1 y un 28 serigrafiado en el JPAC. El pin 1 del JAMMA es aquel que le quedan 18 pines para llegar al que has testado (el palanca-arriba).
Una vez lo pinches, enchúfale un teclado a donde pone Keyboard, y un cable PS/2 que en el otro extremo llegue al PC.
Avísame.