¿Y como es que nadie ha mencionado todavía algunas de las joyas de SNK?
Para los que disfruten con los juegos de lucha ahí va una buena hornada:

King of Fighters 97
King of Fighters 98
... hasta el 2003 y los hacks aunque los últimos ya no me gustan tanto (gracias Playmore )

Last Blade
Last Blade 2

No os olvideis de la saga Real Bout Fatal Fury, merecen la pena.

De Capcom recomiendo los X-Men Vs. Street Fighter y los Marvel Super Heroes Vs. Street Fighter amén del Marvel Vs. Capcom: Clash of Super Heroes.

Algunos shooters muy buenos son el Blazing Star, Vasara, Vasara 2 y como ya han dicho antes también añadiría por su dificultad el Mars Matrix y el Progear que son desquiciantes.
Estos de los que se pueden emular, claro. Si no el listado aumentaría considerablemente.

Un saludete.