Me parece recordar que cuando han sacado alguna actualización, han tardado un poco más en sacarla para un formato que para otro, con lo cual sí que parece haber diferencias, al menos internas, en como funcionan. Pero en el uso práctico no he oido nada de si un sistema es mejor o peor. Normalmente estoy viendo que la gente opta por uno dependiendo de si ya tienen alguna cámara de fotos, mp3 o similar en casa, por utilizar el mismo tipo de tarjeta.
Desde luego las sd's son las que más se están vendiendo, supongo que por ser un formato más difundido, pero si alguien tiene algún dato que aportar en favor de alguno de los dos sistemas, yo también se lo agradecería.