Pues la idea me parece estupenda... perooooo, le pongo una pega... para qué hackearlos? quiero decir que lo mejor es conectarlos todos vía puerto paralelo o con adaptadores comerciales por puerto usb, de ese modo los mandos siguen siendo originales y si se te rompen solo tendrás que comprar uno nuevo. Además, en el caso de la psx o n64 podrás tener controles analógicos y vibración.

Mucho ánimo con el proyecto.