Con el EZFlash 2 la cosa va así.
Primero debes instalar el dispositivo en tu PC, para el EZFlash 2 debes descargar el archivo EZClient de la web del EZFlash, el Ez Client es para Ez Flash I/II (Ez 3 Manager es para el EZFlash3).
El archivo que descargues ya incluye software y drivers.
Una vez instalado pasaté por aquí, que lo explican muy bien http://www.gbplanet.net/planetlinker/tutorials/gba.htm
Espero que te aclere un poco las cosas.