Eso que dices se puede hacer con un .bat:



creo que en la primera línea habría que poner start joytokey.exe ya que si no, todo se ejecutaría en un hilo y hasta que no terminase joytokey, no se ejecutaría juego.exe. Con el start indicaríamos que se ejecutara joytokey en paralelo. Y el kill.exe tampoco recuerdo si ese era exactamente el nombre del ejecutable para "matar" procesos.