Bueno. Yo con las automatizaciones de photoshop no me manejo muy bien. Es decir, para todo lo interno del programa, voy bien, pero a la hora de grabar, tengo mis dudas. Porque si incluyes el grabado de imagen dentro del propio bucle a automatizar, nunca me salen bien los nombres de archivo (todos se sobreescriben con el mismo nombre, por ejemplo). Y si uso el grabado del propio automatizador, pues no se cómo reducir colores, optimizar, etc...

Pero bueno, sea como sea, no supone ningún problema grabar todas las imágenes con su nombre original (pero recortadas) en una carpeta. Luego, con un renombrador de archivos, se le puede poner una A o B al final.Es decir:

Renombrar Imágenes originale -> Recorte izquierdo a una carpeta -> Recorte derecho a otra carpeta -> Añadir A o B al final de los archivos dentro de cada una de las carpetas.

De todos modos, lo más fácil, creo que es ponerle al archivo sin recortar el nombre del juego. Y así, una vez se haya recortado la imagen, los dos recortes heredarán el nombre.

El photoshop que uso es el 7, pero lo que hago es un simple redimensionado del lienzo, así que cualquiera debería valer (me imagino que todos traerán la automatización de procesos).