1º Sí, pero no es recomendable. El mayor aliciente de usar Advmame es su particular uso de los modos de video que permiten usar resoluciones originales.
Si haces un "estiramiento" de pantalla, pierdes esa virtud.
Para eso usa el port del MAME de Dos, normal y corriente, además que es más fácil de configurar.

2º Sí, modifica el autoexec.bat y añade la linea para que cargue los controladores de memoria expandida de Dos...(cswdmpi.exe), con eso ganas rapidez.

3º No. Al menos...que yo sepa.