Bueno ya he realizado las pruebas y estoy decepcionado, no he notado mejora en el rendimiento de los programas con respecto a la primera versión. Os cuento las pruebas que he realizado.
1)Como ya explique tenía una sb vibra16 que es isa, por tanto tuve que instalar los controladores, para esto realice los siguientes pasos
1)entré en el aptitude e instalé el isapnptools
2)ejecute pnpdump > /etc/isapnp.conf para generar un fichero con la información de los dispositivos pnp
3)ejecute modprobe sb io=0x220 irq=5 dma=1 dma16=3
y con esto queda activa la tarjeta de sonido

Compile el kernel para mi procesador y os comento los resultados.
Como no me gustan los juegos de peleas, ejecute el sf2ce, selecciono 1 jugador y seleccione E. Honda, despues dejo que el contricante me machaque sin mover los controles, y apunto el minimo y el máximo que me da durante la primera pelea
sfce2 - antes de compilar el nucleo free 100% - 80% y 86% (En la pantalla de pelea) sfce2 - despues de compilar el nucleo y poner la opción pentium 3 free 100% - 86% y 90% (En la pantalla de pelea) sfce2 - con las versiones que me has preparado version 1) free 100% - 86% y 90% (En la pantalla de pelea) version 2) free 100% - 86% y 90% (En la pantalla de pelea) version 3) free 100% - 86% y 90% (En la pantalla de pelea) Como puedes ver no ha mejorado los fps con las opciones compiladas especialmente para pentium 3
Solo me queda la prueba de aumentar la prioridad al proceso con nice a ver que es lo que pasa. Y rehacer el interface para el puerto paralelo, ya que lo tengo en filas y no en columnas como sugieres...
Una pregunta
¿Aunque lo tenga configurado en filas, me debería reconocer algunos movimientos? como compruebo que esta funcionando, cada vez veo mas cerca el final...