Pues nada, Sky, lo dicho, que no me reconocía el nombre de usuario y la clave. Total, que reinstalé de nuevo y ya fue todo bien. Pero a la hora de compilar, no funcionaba (no me acuerdo del mensaje, que ya era muy tarde ). Al final, cansado de tantas peleas instalé XP y en esas estoy, intentando optimizarlo como pueda. Cuando reuna ánimos me pondré de nuevo con el XP y así tendremos una comparativa en un mismo ordenador de tres rendimientos de MAME. De momento:

Windows XP normal: 135fps (Street Fighter Alpha 3 en el logotipo)
Windows XP optimizado (pero todavía con explorer.exe): 149fps

De todos modos, la gran mejoría está en la velocidad a la que se ejecuta el mamewah y lo rápido que cargan los juegos. Cuando tenga el linux ya veremos cómo mejora la cosa.