wenas
ese emu o te va bien, o te lias a configurar :S yo cuando me lo baje no tuve que configurar nada, creo...
prueba esto:

1.menu -> atari -> rom images - en 5200, elegir la ruta y el archivo de la bios de la 5200 (el resto son para bios de ordenadores)

2.menu -> atari -> machine type : asegurate de que tengas elegido la 5200

3.que el juego que intentes cargar sea realmente de la 5200, y no de los ordenadores (no recuerdo si habia que descomprimirlos U_U, sorry) (en el menu -> File -> attach cartridge)

4.mandar a por tabaco el emu este y probar el kat5200 si solo te interesa la 5200 y no los ordenadores