Yo todavía no me he metido con estas cosas, pero creo que como ha dicho armenta lo mejor es:

Joystick 1 - Arriba-Abajo -> Avanzar de juego en juego
Joystick 1 - Izquierda-Derecha -> Avanzar de 30 en 30 (por poner un número) o de letra en letra
Joystick 2 - Izquierda-Derecha-> Cambio de emulador
Joystick 2 - Arriba-Abajo -> Cambio de lista (todos los juegos, favoritos, peleas, etc... como lo tengamos cada uno)

Los botones, como tengo 8 prefiero no utilizarlos, para que la peña no dude de cuál es el correcto. Solo usaría el botón de start 1 o start 2 para empezar los juegos.