Pues yo no entiendo nada.

Quieres decir que pulsas arriba y se te enciende SOLO el botón 1?

Si es eso, es que no has mapeado correctamente el driver.

En cuanto a las teclas de control, algo tendrás mal si no te las reconoce el driver. Comprueba los cables y asegúrate de que intentas leer esos botones con el driver correcto, el del joystick 1 o el del 2.