Efectivamente, como dice Macarro, El mame del pack 0.104 del emule viene con snaps, cpanels, cabinets, etc, y por eso pesa un 1 gb. Lo se porque yo me descargue ese pack.
Ahora, con la ayuda de Macarro y del Clrmamepro he ido actualizándolo y ya voy por la 0.106.

Por cierto ¿hay alguna diferencia notable entre jugarlo en windows y jugarlo en DOS? Es que yo siempre lo hago en Windows con el Mame32 y el M32 Plus.

Solo tienes que poner todas las roms juntas en la carpeta "roms" del mame, abrir el Mame y hacer un escaneo (File > Audit all games), o pones las roms todas juntas en la carpeta que quieras y en el mame, en opciones le pones el directorio de esa carpeta y despues haces el escaneo.