Poco te puedo ayudar en la optimizacion de mame plus, tengo la misma version que tu y tampoco consigo que funcionen con soltura los juegos poligonales, pero por lo que he leido por los foros es mas o menos normal ya que el mame intenta hacer una emulacion lo mas fiel posible usando solo la cpu, no recurre a la targeta grafica.

Te recomiendo que hagas lo que hice yo, usar el zinc emulator (namco), este si que recurre a la vga y los juegos 3d van muy bien, incluso he podido usar las roms y chd's del mame en el zinc, ahora solo falta encontrar un emulador de model2 que vaya mas o menos bien porque nebula deja mucho que desear.

Ya se que la respuesta no es lo que esperabas pero espero haberte ayudado .

Saludos