Bueno yo tuve un problema mas o menos parecido cuando lo ejecutaba en windows xp. pero no se si haz probado aplastando el boton q esta al lado de la tecla numero 1 bajo el escape y poner q tipos de roms deseas que se muestren. o sea alli dice show parent or clone, only present, only neogeo y cosas asi.. mas luego te pongo un ejemplo.