Bienvenido al foro, gracias por que sea de tu agrado. Es cierto que este foro es diferente a otros y esa es su mayor virtud.

En cuanto a tu problema, las ROMs de MAME cambian en cada versión de MAME. A veces son pocos los cambios y otras veces más... esto hace que MAME deje de reconocer los ficheros y por tanto no los use. Para solucionar tu problema debes usar un gestor de roms (CLRMAMEPRO o ROMCENTER).

Te recomiendo que le eches un vistazo a estos tutoriales:

http://www.marcianitos.org/tutoriales/tutoroms.htm

http://www.youtube.com/watch?v=sIVGFB1Vj6k

En ese orden . Con ello lo tendrás todo más claro.

Un saludo.