Hola,

yo tengo MSDOS + ADVMENU + ADVMAME, y efectivamente muchos juegos con más de 240 líneas (como muchos verticales) les pasa eso, que se cortan. Eso ocurre porque trata de emitir con frecuencias entrelazadas.

La única manera que yo sepa de arreglarlo es mediante modelines. No sé, si quieres te miro qué modeline utilizo para el Galaga, y si te va bien, pues oyes, todos los juegos con la misma resolución del Galaga se te habrían resuelto.