Yo he usado MAME Plus 0.108. De todos modos, es raro ya que el driver de Neo Geo es el mismo para los tres juegos. De todos modos, la informática es así. Yo repetiré mi prueba y a ver qué sale.

Apuntados están tus resultados, gracias por la ayuda

PD.- En el fraps, le das al botón de benchmark, esperas el tiempo que consideres oportuno y al darle de nuevo al botón, te muestra en pantalla en rojo los fps medios. De todos modos en un archivo con extensión .log en la carpeta del fraps te apunta también los fps mínimos, máximos y los medios.