Después he hecho otro scan y ha tardado menos de 1 minuto. Quizás a coincidido el scan del clrmame con el scan del antivirus, porque si no no me explico como ha tardado tanto la primera vez. El ordenador es un AMD Athlon XP 3000 64 bits, con un giga de RAM.

Deciros que ya he solucionado el problema, aunque de una forma un poco radical.

Lo primero que he hecho ha sido borrar todos los mames y roms que tenía (tenía muy pocas).

Me he bajado el mame plus, y he ido a bajarme la rom del double dragon (me encanta este juego). Al ir a bajarme la rom me he dado cuenta de que había una que ponía Double Dragon (Japan) y ocupaba aproximadamente medio mega, y me la he bajado.
Antes me estaba bajando las que ocupaban 50 kb ¿Era ese el problema?