Pues no se como, si se puede, decirle al advance mame como elegir las resoluciones, pero date cuenta que intenta elegir multiplos enteros (2) y no (1'01). O tambien puede que busque el refresco vertical exacto frente a la resolucion XY. Es mejor conseguir el refresco exacto porque una resolucion mayor se puede ajustar via potenciómetros y el resultado es el mismo.

Las resoluciones distintas que dices es porque una está creada a partir de la otra por el propio emulador.