Actualmente, tanto romcenter como clrmamepro son capaces de utilizar los dat de uno en el otro (hace tiempo había dats para romcenter y para clrmamepro).

Aunque los dos tienen básicamente las mismas opciones, romcenter es más bonito y más sencillo de usar. Pero a mi nunca me ha creado mucha confianza ya que de vez en cuando me ha dado algunos fallos (roms que no reconocía, indicaba fallos inexistentes, etc...).