Bueno.....al final me he salido con la mia, con 2 cojones.....
A ver si encontrais las diferencias.....


La respuesta, esta:

(la primera foto es del Final Fight, con el Advmame, la segunda es con el Mame32+)
A ver, todo el problema residia en la tarjeta gráfica.
Estaba usando una GeForce 4 MX 440, junto con el svgawin.exe...pués nada...que no habia manera.
He cambiado la gráfica por una GeForce 2 MX...y tachán!!!!

Bueno, dado que el monitor de la Naomi es de 31Khz, saca las resoluciones al pelo.....es decir, por ejemplo con el Final Fight, saca los 384x224x60, pero claro, al ser a 31Khz...adios a las scanlines generadas por Hard...la imagen queda como si de un monitor de PC se tratase.
Sin tocar nada se me veria a su resolución original y tasa de refresco original, eso sí...a 31Khz:


También, el monitor está obligado sólo al uso de los 60Hz, por lo tanto, frequencias superiores no las admite.
En un monitor de PC, al poder soportar frequencias más elevadas, podria escoger la resolución exácta, sólo que en vez de a 60Hz, seria a 120Hz....(tal como lo tengo en la Vertical Arcadium)
Para el caso es lo mismo, tanto dá doblar la resolución, como la tasa de refresco, la diferencia es inapreciable...(es lo bueno que tiene el Advmame...)

Ya estoy feliz!!!!!