Si, todos los mods que hay del MAME oficial usan las mismas roms y en algunos casos, algunas más. En el caso de MAME Plus, en su última versión, dichas roms extra son unos 180 MB más. En otros mods, pues ni idea.

Y en cuanto a los filtros, si, no te preocupes, la configuración por defecto que trae es igual que la de MAME normal. Los filtros que trae MAME Plus son los típicos de otros emuladores, super 2xsai y similares:

http://elektron.its.tudelft.nl/~dalikifa/