Esto me ha pasado a mi con el mameplus y ademas me ralentizaba el juego (bubble buble memories por ejemplo)... yo activaba y desactivaba triple buffer y demas opciones de imagen pero no parecia tener nada que ver. Lo que he hecho es iniciar el mame32 oficial (en el que no me pasaba) y comparar ambas configuraciones: la unica diferencia que he visto es que en mameplus el sample estaba a 44000 y en mame a 48000 (o al reves) puse el mameplus en la misma calidad de sample que el mame y solucionado.